上海交大内蒙古研究院成功组织研发完成世界首例双峰驼45K液相育种芯片

发布日期:2024-11-19阅读次数: 42

内蒙古自治区养殖骆驼历史悠久,是全国双峰驼主产区之一,驼肉驼奶等特色产业蓬勃发展,已成为支撑地方发展,助力农牧民增收致富的重要产业,具有极大的发展潜力。


但骆驼产业整体起步较晚,大部分处于野生放牧状态,选种选配仍以表型为主,生产力水平极低,双峰驼平均产乳量仅为1kg/d,难以满足快速增长的市场需求,亟待借助现代育种技术,加速遗传改良的进程和效率,为产业发展提供科技支撑。


自2020年起,研究院围绕骆驼遗传育种、繁殖发育、营养饲料和疫病控制等方向,着力从根本性解决骆驼生产性能低的难题出发,支持上海交通大学孟和教授团队深入一线,先后开展《动物检测生物芯片的创制和应用》《戈壁红驼繁育及疫病防控关键技术研究》《内蒙古戈壁红驼产业基本问题研究》等科研项目,历经四年,经过数次实验论证,双峰驼45k液相育种芯片成功研发并于近日发布。


双峰驼45k液相育种芯片基于前期构建的双峰驼高精度基因组参考序列图谱,并通过全基因组关联分析(GWAS)鉴定获得泌乳性状有效分子标记,为双峰驼育种、双峰驼种质资源研究和保护提供了更高效、更精准的检测新工具,对建立我国自主可控的骆驼基因组选择育种体系,开展双峰驼生物学研究和种质创新具有重要意义。


技术创新要点

芯片以深厚的骆驼基因组学研究为基础,参考课题组最新构建的T2T基因组序列图谱以及戈壁红驼、阿拉善双峰驼、苏尼特双峰驼、青海骆驼、新疆塔里木双峰驼、新疆准噶尔双峰驼、单峰驼等多个品种基因组重测序数据,信息来源广泛,具备极高的科研参考价值。


芯片基于靶向测序基因型分型技术捕获基因组的标记信息,并利用二代测序对目标区段进行深度测序。能够快速、高效、低成本的检测和挖掘高质量、高精度的基因变异信息,加速畜禽育种的遗传学分析进展。


关键指标

高密度基因组分子标记,对芯片上的目标位点及其周围SNP位点进行分型,45K的芯片高质量的SNP,相比于传统的固态芯片,每个位点的平均分型成本更低,可以实现骆驼的大规模分型检测。


丰富的候选基因功能位点,以深厚的骆驼基因组学研究为基础,筛选聚焦骆驼乳生产性状等性状显著相关的位点49个,增加了利用该芯片进行相关研究的准确性。


上海交通大学内蒙古研究院始终致力于推动科技成果向现实生产力转化,下一步,将立足地方发展所需,依托交大科研人才优势,发挥引才聚智、辐射带动、示范引领的作用,让更多前沿科技成果在自治区落地生“金”,为地方经济高质量发展贡献新的力量。